专职辅导员有编制，专职辅导员纳入学校事业编制，具备思政教师与职员双重身份，具有教师专业技术职务、管理职员职级、政管理职务三线晋升通道。如果学校的专任教师是事业编，那专职辅导员就应该是事业编。
专职辅导员入职是有编制的，也就是说，每个单位应招聘一定数量的专职辅导员来负责校园辅导工作。专职辅导员编制根据学校情况、学生群特点、学校教育办学优势特色、办学规模、教育资金的使用及人力资源的分配等情况而定。
在编制设置上，不单单考虑辅导工作的完成，还应考虑学校教育改革的要求，以促进学校教育的有效开展，同时应考虑财政预算的负担，以保证招聘专职辅导员的合理性。
此外，专职辅导员编制还需要考虑各种人力资源分配的情况，比如分配各种职能和形式，如分类分组、专题研讨、辅导活动、统一安排等，这样才能有效的开展辅导工作，让学生能受到更有效的帮助。